I fluoropolimeri sono una classe di polimeri contenenti legami carbonio-fluoruro, caratterizzati da un'elevata resistività ad ambienti difficili. Tra i fluoropolimeri disponibili in commercio ci sono Teflon^™ (PTFE), Halar^® (ECTFE) e Kel-F^® (PCTFE). La lavorazione laser dei fluoropolimeri può essere realizzata con un laser a CO₂ da 10,6 o 9,3 micron, senza un'apprezzabile differenza nella qualità del processo. I fluoropolimeri non assorbono subito l'energia del laser a fibra da 1,06 micron, che quindi è sconsigliato per questi materiali. Il taglio laser dei fluoropolimeri con un laser a CO₂ produce un bordo pulito con una minima fusione lungo il percorso di taglio e senza scolorimento. L'incisione dei fluoropolimeri con un laser a CO₂ crea profondità e una limitata rifusione in corrispondenza del punto di ablazione.