Фторполимеры — это класс полимеров, содержащих связь углерод-фтор, которые отличаются высокой устойчивостью к суровым условиям среды. Примеры выпускаемых промышленным способом фторполимеров: Teflon^™ (PTFE), Halar^® (ECTFE) и Kel-F^® (PCTFE). Лазерная обработка фторполимеров может производиться с помощью CO₂‑лазера с длиной волны либо 10,6 микрон, либо 9,3 микрон. В обоих случаях заметной разницы в качестве обработки не наблюдается. Фторполимеры практически не поглощают энергию волоконного лазера с длиной волны 1,06 микрон, поэтому такая обработка не рекомендуется для этих материалов. При лазерной резке фторполимеров CO₂‑лазером образуются четкие грани с минимальным оплавлением по краям разреза и минимальным изменением цвета. При лазерной гравировке фторполимеров с помощью CO₂‑лазера в точке абляции образуется глубокая прорезь с ограниченным оплавлением.